以前の記事で、ランダムフォレスト（RF）による記述子の特徴量解釈について、少し触れました。aimedchem.hatenablog.com予測に関する記述子の役割をより深く考察するのに、shapley 値を用いた SHAP というものがあります。 Shapley 値はゲーム理論に基づき算…

機械学習モデルを研究や開発の現場で活用しようとする試みが盛んですが、様々な要因で難航しているのではないでしょうか。 その一つとして、折角苦労して作ったモデルが役に立たない、ということが挙げられます。機械学習モデルを作ることが目的ではなく、（…

ケモインフォマティクスにおける Mordred は、化学構造から簡便に記述子を算出してくれる便利なライブラリです。aimedchem.hatenablog.comしかし、どんな分子でも記述子を計算してくれる訳ではなく、時々計算が出来ずにエラーを吐き出します。 エラーの種類…

ケモインフォマティクスでは回帰問題、あるいは判別問題をよく扱います。様々な機械学習モデルがあると思いますが、最も使いやすいモデルとして、ランダムフォレスト（RF）があります。RF の数学的原理を解説しているサイトは多数あるので、ここでは触れませ…