ご注文はリード化合物ですか?〜医薬化学録にわ〜

自分の勉強や備忘録などを兼ねて好き勝手なことを書いていくブログです。

2021-02-07から1日間の記事一覧

小ネタ:Mordred で算出した記述子の欠損値処理

ケモインフォマティクスにおける Mordred は、化学構造から簡便に記述子を算出してくれる便利なライブラリです。aimedchem.hatenablog.comしかし、どんな分子でも記述子を計算してくれる訳ではなく、時々計算が出来ずにエラーを吐き出します。 エラーの種類…

小ネタ:ランダムフォレストの実装 + モデルの保存方法 + プロット作成の基本

ケモインフォマティクスでは回帰問題、あるいは判別問題をよく扱います。様々な機械学習モデルがあると思いますが、最も使いやすいモデルとして、ランダムフォレスト(RF)があります。RF の数学的原理を解説しているサイトは多数あるので、ここでは触れませ…